Padroado Regio - Brasil Império

A recente eleição do Papa Francisco contribuiu para 
chamar a atenção sobre a Companhia de Jesus, ordem 
religiosa da Igreja Católica, da qual o Papa faz parte. 
Sobre a Igreja, os jesuítas e a sua relação com a história 
do Brasil, assinale a(s) alternativa(s) correta(s). 
01) A Companhia de Jesus foi a Ordem Religiosa de 
maior destaque na colonização portuguesa do Brasil, 
pois os jesuítas tiveram forte presença na vida social 
da colônia. 
02) Em diversos momentos da história colonial, os 
colonizadores portugueses e os jesuítas entraram em 
choque em razão, dentre outros motivos, da oposição 
dos jesuítas à escravização dos índios por parte dos 
demais colonizadores do Brasil. 
04) Expulsos do Brasil, em 1680, os jesuítas não puderam 
mais atuar no Brasil e foram substituídos pelos 
franciscanos. 
08) As Missões fundadas pelos jesuítas tinham como 
objetivo reunir grupos de nativos em aldeamentos 
para promover sua conversão e sua aculturação. 
16) O Padroado Régio foi uma aliança entre a Coroa 
Portuguesa e a Igreja Católica, por meio da qual o 
governo português detinha controle sobre as ações da 
Igreja.

Duvida: A 16 é considerada correta e eu sei um pouco desse negocio do Padroado Régio; mas vocês concordam que ele era uma "aliança" entre a Coroa e a Igreja? A igreja não gostava do Padroado (certo?), então por que é correto definir isso como um acordo/aliança?

Olá!
  Também pouco sei sobre o Padroado Régio, mas não li em nenhum lugar que a Igreja não gostaria do Padroado. Isso porque essa instituição entregou à Coroa as rédeas do mundo religioso, já que, em troca, firmaram-se acordos para a sua proteção em meio às ofensivas da Reforma Protestante.
  Além disso, considerando que isso ocorreu no período da Expansão Marítima, a Igreja passou a contar com a sua função política para expandir a fé católica para as novas terras hereges, como a própria Companhia de Jesus aqui no Brasil.
  Por fim, é importante ressaltar, que apesar da Coroa poder escolher quem ocuparia certos cargos, a alta hierarquia da Igreja ainda tinha certa autonomia (até porque alguém do Clero deveria sobrar nesse meio para receber as regalias dos acordos). De fato, achei curioso aprender que quem propôs o Padroado Régio foi um papa. Assim, apesar de certos ramos religiosos poderem gostar ou não, havia sim uma aliança política, que transcenderia um simples acordo falado.
  Para responder melhor, dei uma lida nesse pdf aqui, caso tenhas interesse: https://www.redalyc.org/pdf/3373/337349577006.pdf (páginas 6 e 7).

Entendi Fernanda! 
Eu entendi porquê fiquei confuso: quando li Padroado Régio eu lembrei da Questão Religiosa que houve entre a Igreja Catolica e o Dom Pedro II durante o segundo reinado no Brasil. Por isso achava que a Igreja não gostava do Padroado; mas o Padroado vai MUITO além do desentendimenro religioso da Questão Religiosa. 
Obrigado!